Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VdrP48281 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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VdrP48281 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VdrP48281 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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VdrP48281 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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