Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
PtprmP28828 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms