Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms