Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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Ccl20O89093 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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Ccl20O89093 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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Ccl20O89093 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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Ccl20O89093 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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