Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms