Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc6D3YZP9 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms