Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Brpf1B2RRD7 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Brpf1B2RRD7 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms