Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms