Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms