Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Uhrf1Q8VDF2 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Uhrf1Q8VDF2 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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