Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Trim35Q8C006 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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