Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Clcn1Q64347 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Clcn1Q64347 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms