Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Trim28Q62318 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim28Q62318 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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