Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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