Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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