Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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