Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms