Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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Sh3bp1P55194 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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Sh3bp1P55194 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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