Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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