Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms