Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Opn1mwO35599 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Opn1mwO35599 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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