Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Usp9yF8VPU6 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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