Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms