Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms