Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rabgef1Q9JM13 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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