Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnft1Q9DCN7 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms