Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rprd1bQ9CSU0 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rprd1bQ9CSU0 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rprd1bQ9CSU0 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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Rprd1bQ9CSU0 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rprd1bQ9CSU0 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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