Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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