Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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