Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Usp48Q3V0C5 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Usp48Q3V0C5 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms