Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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