Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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