Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Vps8Q0P5W1 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Vps8Q0P5W1 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms