Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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Sh3bp1P55194 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp1P55194 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms