Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtpreP49446 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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