Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SrprbP47758 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SrprbP47758 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms