Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd10P28359 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd10P28359 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd10P28359 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd10P28359 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Hoxd10P28359 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd10P28359 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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