Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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