Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Casq1O09165 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Casq1O09165 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Casq1O09165 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Casq1O09165 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms