Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms