Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms