Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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