Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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Bco1Q9JJS6 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Bco1Q9JJS6 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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