Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SgshQ9EQ08 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SgshQ9EQ08 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms