Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms