Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Top1mtQ8R4U6 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Top1mtQ8R4U6 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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