Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Atg4aQ8C9S8 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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