Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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