Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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