Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms